sequenziamento

Una nuova tecnica basata su codici a barre RNA sta riscrivendo le regole della mappatura cerebrale. Un gruppo di ricercatori della University of Illinois Urbana-Champaign ha messo a punto un metodo che permette di tracciare migliaia di connessioni neurali con una precisione mai vista prima, arrivando a identificare i collegamenti tra singole sinapsi. Il tutto trasformando quello che era un problema di imaging microscopico in un problema di sequenziamento genetico. E i risultati, pubblicati sulla rivista Nature Methods il 7 aprile 2026, sono già sorprendenti. Nei topi, questa tecnologia ha rivelato connessioni tra cellule cerebrali che nessuno sapeva esistessero. Il che apre scenari enormi, dalla comprensione dell'architettura profonda del cervello fino alla possibilità di intercettare malattie neurodegenerative come l'Alzheimer in fasi molto precoci. «Quando si progetta un computer, bisogna conoscere i circuiti dell'unità di elaborazione centrale. Se non si sa come tutto è collegato, non si può capirne il funzionamento, ottimizzarlo o ripararlo quando qualcosa si rompe. Stiamo affrontando il cervello nello stesso modo», ha spiegato Boxuan Zhao, professore di biologia cellulare e dello sviluppo alla University of Illinois e responsabile dello studio. Come funziona Connectome-seq: dai neuroni al sequenziamento Fino a oggi, mappare il cervello era un lavoro lento e faticoso. Gli scienziati dovevano tagliare il tessuto cerebrale in sezioni sottilissime, fotografarle al microscopio e poi ricostruire manualmente i percorsi delle connessioni. Le tecniche più recenti basate sul sequenziamento riuscivano a etichettare molti neuroni contemporaneamente, ma mostravano solo dove un neurone si estende, senza identificare con precisione le cellule con cui si connette a livello sinaptico. Per superare questo limite, il team di Zhao ha sviluppato una piattaforma chiamata Connectome-seq. Il principio è elegante nella sua semplicità concettuale: ogni neurone riceve un codice a barre RNA unico. Proteine specializzate trasportano questi codici dal corpo principale del neurone fino alla sinapsi, il punto esatto dove due neuroni si incontrano. A quel punto i ricercatori isolano le sinapsi e, tramite sequenziamento ad alta produttività, leggono quali coppie di codici a barre si trovano insieme. Se due codici si ritrovano nello stesso punto, significa che quei due neuroni sono direttamente collegati. Zhao ha usato una metafora piuttosto efficace per spiegare il meccanismo: «Immaginate un grande mazzo di palloncini. Il corpo principale di ogni palloncino ha i suoi adesivi con codici a barre unici, e alcuni si spostano verso l'estremità del filo. Se due palloncini sono legati insieme all'estremità, i due codici si incontrano nel nodo. Poi tagliamo i nodi e sequenziamo i codici a barre in ognuno. Se lo stesso nodo contiene adesivi del palloncino A e del palloncino B, sappiamo che quei due palloncini sono legati. Facciamo la stessa cosa nel cervello, solo a livello di migliaia di cellule neuronali.» Nuove connessioni scoperte e prospettive sulla ricerca neurologica Utilizzando Connectome-seq, il gruppo di ricerca ha mappato oltre 1.000 neuroni in un circuito cerebrale del topo noto come circuito pontocerebellare, che collega due regioni del cervello. L'analisi ha portato alla luce schemi di connettività finora sconosciuti, inclusi collegamenti diretti tra tipi cellulari che non si sapeva comunicassero nel cervello adulto. «La nostra tecnologia consente la mappatura simultanea di migliaia di connessioni neurali con risoluzione a singola sinapsi, una capacità che non esiste in nessuna tecnologia attuale», ha dichiarato Zhao. Il team sta già lavorando a miglioramenti, con l'obiettivo dichiarato di arrivare un giorno a mappare l'intero cervello del topo. Ma la portata va ben oltre la ricerca di base. Dato che Connectome-seq è veloce e scalabile, potrebbe accelerare enormemente gli studi sulle malattie neurodegenerative, sui disturbi psichiatrici e su altre patologie cerebrali. Confrontando le connessioni cerebrali di individui sani con quelle di soggetti a diversi stadi di malattia, gli scienziati potrebbero individuare cambiamenti precoci nei circuiti neurali. «Con gli approcci basati sul sequenziamento, tempi e costi si riducono enormemente, e questo rende davvero possibile osservare le differenze tra cervelli diversi. Potremmo vedere dove le connessioni cambiano, dove si trovano le parti più vulnerabili del cervello, forse prima ancora che i sintomi compaiano», ha aggiunto Zhao. «Per esempio, se riuscissimo a individuare esattamente l'anello debole che innesca l'intera cascata catastrofica nell'Alzheimer, potremmo rafforzare specificamente quelle connessioni fino al punto in cui la malattia rallenta o non progredisce più?»

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